Les factures rectificatives que genera WinOmega són documents per substitució. És a dir, s'hi consignen els nous imports tal com queden després de la rectificació efectuada. Aquesta modalitat, si bé originalment era l'única permesa (segons article 13 del Reial Decret 1496/2003, actualment derogat), és avui una de les dues maneres que permet la llei (segons article 15.5 del Reial Decret 1619/2012).
Recomanem consultar també al manual del programa, secció Facturació > Clients> Canvis, subsecció Factures rectificatives).
En tractar-se de documents que substitueixen l'original, totes les línies de la factura rectificada queden automàticament sense efecte, sent les línies de la factura rectificativa les que ocuparan el seu lloc.
Per això, per anul·lar una operació no heu d'introduir línies negatives que "compensin" l'operació anterior. Només cal eliminar la línia corresponent en generar la factura rectificativa.