Alguns usuaris tenen el programa funcionant satisfactòriament en sistemes Linux i Mac OS, utilizant Wine o Crossover com a intermediari. Si bé nosaltres no podem donar cap garantia de perfecte funcionament de WinOmega en aquestes condicions, animem a provar-ho a qui pugui estar-hi interessat, tenint bona cura d'obtenir regularment còpia de seguretat de les seves dades. Les incidències que el programa pugui tenir amb Wine es troben detallades en aquesta pàgina.
Una altra manera de fer-ho és mitjançant la creació d'una màquina virtual que executa Windows en una mena de caixa isolada en el vostre Mac OS o a qualsevol distribució de Linux. Dins d'aquesta caixa podreu obrir tots els programes de Windows al vostre ordinador de la mateixa manera que ho faríeu en el sistema operatiu de Microsoft. Podeu tenir fàcilment aquesta màquina virtual instal·lant VirtualBox al vostre sistema, que és un producte gratuït d'Oracle Corporation. Per a més detalls caldria anar al lloc de VirtualBox.
Altres màquines virtuals que es fan servir per a executar programes de Windows en Mac OS són Parallels Desktop i VMware Fusion.
Malhauradament no podem donar suport detallat més enllà del que hi ha escrit ací, ni assumir-ne cap mena de responsabilitat.